潔凈實驗室的通風系統一般采用組合式空調機組。其送風系統與各行業潔凈室工程的區別在于，并不是所有的實驗室都可以配備回風系統，這取決于用戶的實驗室和實驗產品的使用情況。類似生物安全實驗室，不可能做回風系統，還是要建設成全排潔凈室。實驗室凈化除了以上內容，一定要記住凈化工程的年級設計也很重要。一般情況下，一般無菌室實驗室的潔凈度等級是10000，而一般實驗室的布局設計是100000 ~ 10000。

實驗室凈化系統布局，從目前情況來看，國內大部分二級醫院都在積極開展基因擴增實驗室項目，其中PCR實驗室的設計和建設越來越受到醫學界的重視。按照實驗流程，房間功能為樣品制備區、樣品制備區、基因擴增區、產物分析區。規范中沒有對該區域的清潔度提出要求。如果這個區域有空調，可以凈化到10萬的潔凈度。一般情況下，標準的實驗樓布局需要一個公共走廊，四個相鄰的功能測試區，每個測試區設置一個獨立的緩沖區，可以通過不同的壓差進行控制，避免室內空氣的串聯和二次污染。

潔凈實驗室裝修常用材料選擇要求:實驗室的天花板采用防塵、光滑、阻燃的彩鋼板，兩面用槽鋁密封，彩鋼板用中性中國白玻璃膠密封。實驗室凈化區域專用PVC地板膠鋪地，防火等級Bl，耐酸、耐堿、耐腐蝕、耐磨性能符合國家標準實驗室要求；實驗室墻壁采用防塵、光滑、防火的彩鋼板，鋼板夾層。地槽采用50X30槽鋁，地槽用鋼釘和木塊固定。與地面和墻面、墻面和墻面、墻面和頂棚的過渡采用半徑為50mm的鋁合金圓弧處理；彩鋼板與彩鋼板之間用中性中國白玻璃膠密封，防止裂縫滋生細菌。