潔凈實驗室的通風系統一般采用組合式空調機組。其送風系統與各行業潔凈室工程的區別在于，并不是所有的實驗室都可以配備回風系統，這取決于用戶的實驗室和實驗產品的使用情況。類似生物安全實驗室，不可能做回風系統，還是要建設成全排潔凈室。實驗室凈化除了以上內容，一定要記住凈化工程的年級設計也很重要。一般情況下，一般無菌室實驗室的潔凈度等級是10000，而一般實驗室的布局設計是100000 ~ 10000。

潔凈實驗室一般包括潔凈區、準潔凈區和輔助區。潔凈實驗室的布局可以有以下幾種方式:外廊的環繞風格:外廊可以有窗，也可以無窗，可用于參觀和放置一些設備，部分外廊配有值班暖氣。外窗必須是雙層密封窗。內走廊:潔凈實驗室位于外圍，走廊位于內部。這個走廊的潔凈度水平普遍較高，甚至與潔凈實驗室處于同一水平。兩端:潔凈區位于一側，另一側設有準潔凈及輔助用房。核心型:為了節省土地，縮短管線，可以潔凈區為核心，周圍是各種輔助用房和隱蔽管線空間。這種方式避免了室外氣候對潔凈區的影響，降低了冷熱能耗，有利于節能。

潔凈實驗室裝修常用材料選擇要求:實驗室的天花板采用防塵、光滑、阻燃的彩鋼板，兩面用槽鋁密封，彩鋼板用中性中國白玻璃膠密封。實驗室凈化區域專用PVC地板膠鋪地，防火等級Bl，耐酸、耐堿、耐腐蝕、耐磨性能符合國家標準實驗室要求；實驗室墻壁采用防塵、光滑、防火的彩鋼板，鋼板夾層。地槽采用50X30槽鋁，地槽用鋼釘和木塊固定。與地面和墻面、墻面和墻面、墻面和頂棚的過渡采用半徑為50mm的鋁合金圓弧處理；彩鋼板與彩鋼板之間用中性中國白玻璃膠密封，防止裂縫滋生細菌。