冷凍集裝箱在裝貨過程中，在檢查冷凍裝置，確認冷凍機已停止運轉；，貨物預冷：在裝貨前，要對冷凍集裝箱內使用的墊木和其他襯墊材料要預冷，并要對貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度，因冷箱設計制冷能力有限，僅能用于保持貨物的溫度，關于冷藏集裝箱預冷：一般情況冷藏集裝箱不應預冷，因為預冷過的冷藏集裝箱一打開門，外界熱空氣進入冷藏集裝箱遇冷將產生水汽凝結，水滴會損壞貨物外包裝和標簽，在蒸發器表面凝結的水滴影響制冷量。

涂料防水，集裝箱內部噴涂聚氨酯泡沫，加裝玻璃巖棉板以用來防潮防腐隔熱隔音，南方室內加裝空調、北方則加裝地暖等；強烈建議外層覆裝飾材料，比如歐松板、石膏板、水泥纖維板、高分子裝配板等，鋪設剛性防水層，應在首道柔性防水層完成后的兩天左右進行施工，主要以高等級脂肪酸類砂漿防水劑、水泥、砂子、細石骨料、纖維為基本材料，防水層厚度應以集裝箱廠家要求為主，集裝箱內部為滿足墻面和天花板的防火、隔熱等要求，建議室內采用厚度達標的玻璃巖棉夾心板進行裝飾。

對任何冷藏貨物均不允許出現長時間地停止制冷，對特種貨物和溫度敏感貨物應保持制冷系統連續工作，避免任何溫度波動造成貨物質量下降，集裝箱在海運中如何固定，是旋鎖，這種是放在箱子下面的四個角鍵上的，當然自動鎖是在船下的時候，由工人上到箱子下面，等吊上船的時候自動鎖上，安裝在活動房屋內的接閃器，可根據實際情況采用避雷針、避雷帶或防雷網等接閃器，所選接閃器應具有特定的耐電流和耐壓性、連續接閃器效果，以及接閃器與建筑物之間的美觀統一性。